ImmunityBio与微软拟用GPU算力对COVID-19关键蛋白结构展开建模
新冠病毒疫情爆发后，许多国际研究团队都展开了潜在药物的开发工作，而这显然离不开大量的计算与建模工作。比如免疫疗法初创企业 immunitybio，正在与微软的 azure 云计算部门展开合作。借助 24 petaflops 的 gpu 算力，其得以相当细致地对 covid-19 的关键蛋白结构展开建模，以研究新冠病毒是如何进入人体细胞的。
上图绿色部分为刺突蛋白的受体结合结构区域，红色部分为 ace-2 受体，两者之间的结合，是导致新冠病毒感染的第一步。（图自：immunitybio）
在 auzre 云平台强大算力的帮助下，新合作意味着他们能够在几天之内（而不是单打独斗要耗费的数月时间），完成刺突蛋白的建模工作。
省下来的时间，意味着该模型可以更快地投入研究潜在疫苗和治疗方法的科学家和研究人员手中，以尽快找到抑制病毒复制和防止其附着在人类 ace-2 蛋白受体上的方法。
最简单的一个设想，便是确保刺突蛋白无法与受体瞄准连接。在新冠病毒自愈患者身上，其天然抗体已经能够做到这一点。
目前正在研发的疫苗，专注的也是同一件事。此外，许多治疗方法都在寻求降低病毒感染新细胞、将其锁住以阻断体内复制的可能性。
据悉，微软与 immunitybio 的合作，涉及 1250 套英伟达 v100 tensor core gpu 组件的阵列。
软件巨头将这些 gpu 用于 azure 集群中的机器学习应用，结合 immunitybio 现有的 320 套 gpu 集群，可专门对分子建模工作进行调整。
合作取得的成果，将提供给研究 covid-19 缓解和预防疗法的研究人员，以推动更快、更有效的解决方案的到来。
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